sub-01, task-somato

Raw (original) data-quality raw run-None

Info raw run-None data-quality

	General
	Filename(s)	sub-01_task-somato_meg.fif
	MNE object type	Raw
	Measurement date	1915-03-31 at 00:00:00 UTC
	Participant	sub-01
	Experimenter	mne_anonymize
	Acquisition
	Duration	00:14:58 (HH:MM:SS)
	Sampling frequency	300.31 Hz
	Time points	269,400
	Channels
	Magnetometers
	Gradiometers
	EOG
	Stimulus
	Head & sensor digitization	47 points
	Filters
	Highpass	0.10 Hz
	Lowpass	100.10 Hz

Time series raw run-None data-quality

Move the slider or click on the image and use the ← and → keys to browse.

PSD raw run-None data-quality

Raw (filtered) filtered raw run-None

Info raw run-None filtered

	General
	Filename(s)	sub-01_task-somato_meg.fif
	MNE object type	Raw
	Measurement date	1915-03-31 at 00:00:00 UTC
	Participant	sub-01
	Experimenter	mne_anonymize
	Acquisition
	Duration	00:14:58 (HH:MM:SS)
	Sampling frequency	300.31 Hz
	Time points	269,400
	Channels
	Magnetometers
	Gradiometers
	EOG
	Stimulus
	Head & sensor digitization	47 points
	Filters
	Highpass	0.10 Hz
	Lowpass	40.00 Hz

Time series raw run-None filtered

Move the slider or click on the image and use the ← and → keys to browse.

PSD raw run-None filtered

Events events

Epochs: before cleaning epochs

Info epochs

	General
	MNE object type	Epochs
	Measurement date	1915-03-31 at 00:00:00 UTC
	Participant	sub-01
	Experimenter	mne_anonymize
	Acquisition
	Total number of events	111
	Events counts	somato_event1: 111
	Time range	-0.200 – 0.499 s
	Baseline	off
	Sampling frequency	300.31 Hz
	Time points	211
	Metadata	111 rows × 2 columns
	Channels
	Magnetometers
	Gradiometers
	EOG
	Stimulus
	Head & sensor digitization	47 points
	Filters
	Highpass	0.10 Hz
	Lowpass	40.00 Hz

Metadata epochs

	Epoch #	event_name	somato_event1
	0	somato_event1	0.000
	1	somato_event1	0.000
	2	somato_event1	0.000
	3	somato_event1	0.000
	4	somato_event1	0.000
	5	somato_event1	0.000
	6	somato_event1	0.000
	7	somato_event1	0.000
	8	somato_event1	0.000
	9	somato_event1	0.000
	10	somato_event1	0.000
	11	somato_event1	0.000
	12	somato_event1	0.000
	13	somato_event1	0.000
	14	somato_event1	0.000
	15	somato_event1	0.000
	16	somato_event1	0.000
	17	somato_event1	0.000
	18	somato_event1	0.000
	19	somato_event1	0.000
	20	somato_event1	0.000
	21	somato_event1	0.000
	22	somato_event1	0.000
	23	somato_event1	0.000
	24	somato_event1	0.000
	25	somato_event1	0.000
	26	somato_event1	0.000
	27	somato_event1	0.000
	28	somato_event1	0.000
	29	somato_event1	0.000
	30	somato_event1	0.000
	31	somato_event1	0.000
	32	somato_event1	0.000
	33	somato_event1	0.000
	34	somato_event1	0.000
	35	somato_event1	0.000
	36	somato_event1	0.000
	37	somato_event1	0.000
	38	somato_event1	0.000
	39	somato_event1	0.000
	40	somato_event1	0.000
	41	somato_event1	0.000
	42	somato_event1	0.000
	43	somato_event1	0.000
	44	somato_event1	0.000
	45	somato_event1	0.000
	46	somato_event1	0.000
	47	somato_event1	0.000
	48	somato_event1	0.000
	49	somato_event1	0.000
	50	somato_event1	0.000
	51	somato_event1	0.000
	52	somato_event1	0.000
	53	somato_event1	0.000
	54	somato_event1	0.000
	55	somato_event1	0.000
	56	somato_event1	0.000
	57	somato_event1	0.000
	58	somato_event1	0.000
	59	somato_event1	0.000
	60	somato_event1	0.000
	61	somato_event1	0.000
	62	somato_event1	0.000
	63	somato_event1	0.000
	64	somato_event1	0.000
	65	somato_event1	0.000
	66	somato_event1	0.000
	67	somato_event1	0.000
	68	somato_event1	0.000
	69	somato_event1	0.000
	70	somato_event1	0.000
	71	somato_event1	0.000
	72	somato_event1	0.000
	73	somato_event1	0.000
	74	somato_event1	0.000
	75	somato_event1	0.000
	76	somato_event1	0.000
	77	somato_event1	0.000
	78	somato_event1	0.000
	79	somato_event1	0.000
	80	somato_event1	0.000
	81	somato_event1	0.000
	82	somato_event1	0.000
	83	somato_event1	0.000
	84	somato_event1	0.000
	85	somato_event1	0.000
	86	somato_event1	0.000
	87	somato_event1	0.000
	88	somato_event1	0.000
	89	somato_event1	0.000
	90	somato_event1	0.000
	91	somato_event1	0.000
	92	somato_event1	0.000
	93	somato_event1	0.000
	94	somato_event1	0.000
	95	somato_event1	0.000
	96	somato_event1	0.000
	97	somato_event1	0.000
	98	somato_event1	0.000
	99	somato_event1	0.000
	100	somato_event1	0.000
	101	somato_event1	0.000
	102	somato_event1	0.000
	103	somato_event1	0.000
	104	somato_event1	0.000
	105	somato_event1	0.000
	106	somato_event1	0.000
	107	somato_event1	0.000
	108	somato_event1	0.000
	109	somato_event1	0.000
	110	somato_event1	0.000

111 rows × 3 columns

ERF image (Magnetometers) epochs

ERF image (Gradiometers) epochs

Drop log epochs

No epochs exceeded the rejection thresholds. Nothing was dropped.

PSD epochs

Epochs: after cleaning clean epochs

Rejection thresholds epochs clean

{}

Info epochs clean

	General
	Filename(s)	sub-01_task-somato_epo.fif
	MNE object type	EpochsFIF
	Measurement date	1915-03-31 at 00:00:00 UTC
	Participant	sub-01
	Experimenter	mne_anonymize
	Acquisition
	Total number of events	111
	Events counts	somato_event1: 111
	Time range	-0.200 – 0.499 s
	Baseline	-0.200 – 0.000 s
	Sampling frequency	300.31 Hz
	Time points	211
	Metadata	111 rows × 2 columns
	Channels
	Magnetometers
	Gradiometers
	EOG
	Stimulus
	Head & sensor digitization	47 points
	Filters
	Highpass	0.10 Hz
	Lowpass	40.00 Hz

Metadata epochs clean

	Epoch #	event_name	somato_event1
	0	somato_event1	0.000
	1	somato_event1	0.000
	2	somato_event1	0.000
	3	somato_event1	0.000
	4	somato_event1	0.000
	5	somato_event1	0.000
	6	somato_event1	0.000
	7	somato_event1	0.000
	8	somato_event1	0.000
	9	somato_event1	0.000
	10	somato_event1	0.000
	11	somato_event1	0.000
	12	somato_event1	0.000
	13	somato_event1	0.000
	14	somato_event1	0.000
	15	somato_event1	0.000
	16	somato_event1	0.000
	17	somato_event1	0.000
	18	somato_event1	0.000
	19	somato_event1	0.000
	20	somato_event1	0.000
	21	somato_event1	0.000
	22	somato_event1	0.000
	23	somato_event1	0.000
	24	somato_event1	0.000
	25	somato_event1	0.000
	26	somato_event1	0.000
	27	somato_event1	0.000
	28	somato_event1	0.000
	29	somato_event1	0.000
	30	somato_event1	0.000
	31	somato_event1	0.000
	32	somato_event1	0.000
	33	somato_event1	0.000
	34	somato_event1	0.000
	35	somato_event1	0.000
	36	somato_event1	0.000
	37	somato_event1	0.000
	38	somato_event1	0.000
	39	somato_event1	0.000
	40	somato_event1	0.000
	41	somato_event1	0.000
	42	somato_event1	0.000
	43	somato_event1	0.000
	44	somato_event1	0.000
	45	somato_event1	0.000
	46	somato_event1	0.000
	47	somato_event1	0.000
	48	somato_event1	0.000
	49	somato_event1	0.000
	50	somato_event1	0.000
	51	somato_event1	0.000
	52	somato_event1	0.000
	53	somato_event1	0.000
	54	somato_event1	0.000
	55	somato_event1	0.000
	56	somato_event1	0.000
	57	somato_event1	0.000
	58	somato_event1	0.000
	59	somato_event1	0.000
	60	somato_event1	0.000
	61	somato_event1	0.000
	62	somato_event1	0.000
	63	somato_event1	0.000
	64	somato_event1	0.000
	65	somato_event1	0.000
	66	somato_event1	0.000
	67	somato_event1	0.000
	68	somato_event1	0.000
	69	somato_event1	0.000
	70	somato_event1	0.000
	71	somato_event1	0.000
	72	somato_event1	0.000
	73	somato_event1	0.000
	74	somato_event1	0.000
	75	somato_event1	0.000
	76	somato_event1	0.000
	77	somato_event1	0.000
	78	somato_event1	0.000
	79	somato_event1	0.000
	80	somato_event1	0.000
	81	somato_event1	0.000
	82	somato_event1	0.000
	83	somato_event1	0.000
	84	somato_event1	0.000
	85	somato_event1	0.000
	86	somato_event1	0.000
	87	somato_event1	0.000
	88	somato_event1	0.000
	89	somato_event1	0.000
	90	somato_event1	0.000
	91	somato_event1	0.000
	92	somato_event1	0.000
	93	somato_event1	0.000
	94	somato_event1	0.000
	95	somato_event1	0.000
	96	somato_event1	0.000
	97	somato_event1	0.000
	98	somato_event1	0.000
	99	somato_event1	0.000
	100	somato_event1	0.000
	101	somato_event1	0.000
	102	somato_event1	0.000
	103	somato_event1	0.000
	104	somato_event1	0.000
	105	somato_event1	0.000
	106	somato_event1	0.000
	107	somato_event1	0.000
	108	somato_event1	0.000
	109	somato_event1	0.000
	110	somato_event1	0.000

111 rows × 3 columns

ERF image (Magnetometers) epochs clean

ERF image (Gradiometers) epochs clean

Drop log epochs clean

No epochs exceeded the rejection thresholds. Nothing was dropped.

PSD epochs clean

Condition: somato_event1 evoked somato_event1

Info evoked somato_event1

	General
	MNE object type	EvokedArray
	Measurement date	1915-03-31 at 00:00:00 UTC
	Participant	sub-01
	Experimenter	mne_anonymize
	Acquisition
	Aggregation	average of 111 epochs
	Condition	somato_event1
	Time range	-0.200 – 0.499 s
	Baseline	-0.200 – 0.000 s
	Sampling frequency	300.31 Hz
	Time points	211
	Channels
	Magnetometers
	Gradiometers
	Head & sensor digitization	47 points
	Filters
	Highpass	0.10 Hz
	Lowpass	40.00 Hz

Time course (Magnetometers) evoked somato_event1

Time course (Gradiometers) evoked somato_event1

Topographies evoked somato_event1

Move the slider or click on the image and use the ← and → keys to browse.

Global field power evoked somato_event1

Noise covariance covariance evoked somato_event1

Covariance matrix covariance

Singular values covariance

Whitening: somato_event1 evoked covariance somato_event1

BEM bem

axial bem

Move the slider or click on the image and use the ← and → keys to browse.

sagittal bem

Move the slider or click on the image and use the ← and → keys to browse.

coronal bem

Move the slider or click on the image and use the ← and → keys to browse.

Sensor alignment coregistration

Forward solution forward-solution

	Forward
	Magnetometers
	Gradiometers
	Source space	Surface with 8154 vertices
	Source orientation	Free

Source: somato_event1 source-estimate somato_event1

Move the slider or click on the image and use the ← and → keys to browse.

Configuration file configuration

  """Somato."""

bids_root = "~/mne_data/ds003104"
deriv_root = "~/mne_data/derivatives/mne-bids-pipeline/ds003104"
subjects_dir = f"{bids_root}/derivatives/freesurfer/subjects"

conditions = ["somato_event1"]
ch_types = ["meg"]

System information mne-sysinfo

  Platform             Linux-5.15.0-1057-aws-x86_64-with-glibc2.35
Python               3.12.4 (main, Jun  8 2024, 23:40:19) [GCC 11.4.0]
Executable           /home/circleci/.pyenv/versions/3.12.4/bin/python3.12
CPU                  Intel(R) Xeon(R) Platinum 8124M CPU @ 3.00GHz (36 cores)
Memory               68.6 GiB

Core
├☑ mne               1.9.0.dev59+ged933b8d9 (devel, latest release is 1.8.0)
├☑ numpy             2.0.2 (OpenBLAS 0.3.27 with 2 threads)
├☑ scipy             1.14.1
└☑ matplotlib        3.9.2 (backend=agg)

Numerical (optional)
├☑ sklearn           1.5.2
├☑ numba             0.60.0
├☑ nibabel           5.2.1
├☑ pandas            2.2.3
├☑ h5io              0.2.4
├☑ h5py              3.12.1
└☐ unavailable       nilearn, dipy, openmeeg, cupy

Visualization (optional)
├☑ pyvista           0.44.1 (OpenGL 4.5 (Core Profile) Mesa 23.2.1-1ubuntu3.1~22.04.2 via llvmpipe (LLVM 15.0.7, 256 bits))
├☑ pyvistaqt         0.11.1
├☑ vtk               9.3.1
├☑ qtpy              2.4.1 (PyQt6=6.7.1)
└☐ unavailable       ipympl, pyqtgraph, mne-qt-browser, ipywidgets, trame_client, trame_server, trame_vtk, trame_vuetify

Ecosystem (optional)
├☑ mne-bids          0.16.0.dev44+g65da1ae78
├☑ mne-bids-pipeline 1.10.0.dev27+g02cdc20
├☑ edfio             0.4.4
├☑ pybv              0.7.5
└☐ unavailable       mne-nirs, mne-features, mne-connectivity, mne-icalabel, neo, eeglabio, mffpy

Table of contents